De fleste tager med indenrigsfly fra Bangkok, når de skal til Koh Samui. Der er dog også mulighed for at flyve til den populære ferieø fra blandt andet Phuket og Singapore. Lufthavnen ligger cirka 10 kilometer nord for den populære Chaweng Beach på østkysten, så hvis man vælger at bo i det område, har man ikke langt til sit hotel. Transporten til hotellet kan for eksempel foregå med taxa eller minibus. Hvis man ankommer om aftenen kan det være nødvendigt at forhandle lidt for at nå frem til den rigtige pris. Om dagen er priserne mere faste. Der er også mulighed for at leje bil og selv køre til sit hotel. Det kan være en god løsning, hvis man vil have optimalt udbytte af de mange udflugtsmuligheder på øen. En del rejsende bestiller en pakke med både fly, hotel og transfer, når de skal til Koh Samui, og så er der mindre at overveje. Koh Samui er også centrum for rejsende, der ankommer med fly og hopper videre til øer som Koh Pha Ngan og Koh Tao. Bådene til de andre øer afgår fra havnen i Nathon, som ligger modsat lufthavnen på den vestlige side af øen.